[1]黄欣,徐雅莉,彭理,等.利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱联合磁珠技术寻找乳腺癌血清蛋白标志物[J].中华乳腺病杂志(电子版),2012,6(2):125-139.
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利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱联合磁珠技术寻找乳腺癌血清蛋白标志物()

中华乳腺病杂志(电子版)[ISSN:1674-0807/CN:11-9146/R]

卷:
第6卷
期数:
2012年2期
页码:
125-139
栏目:
论著
出版日期:
2012-04-01

文章信息/Info

作者:
黄欣;徐雅莉;彭理;周易冬;茅枫;关竞红;林燕;孙强
中国医学科学院北京协和医院乳腺外科
关键词:
乳腺肿瘤蛋白质组学基质辅助激光解析电离飞行时间质谱法磁珠差异蛋白峰
摘要:
目的 探索乳腺癌与乳腺良性疾病和健康人血清蛋白质谱表达差异,寻找具有鉴别诊断意义的血清蛋白标志物。方法 实验分为两大组:(1)决策树模型组共293 例标本, 包括3 个亚组,分别为乳腺癌组110 例标本、乳腺良性疾病组113 例和健康组70 例,建立决策树(乳腺癌诊断)模型;(2)盲法验证组共34 例标本, 包括3 个亚组分别为乳腺癌组7 例标本、乳腺良性疾病组13 例及健康组14 例,进行盲筛验证决策树模型。采用弱阳离子磁珠捕获乳腺癌患者血清中的蛋白,使用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)仪检测绘制蛋白峰。应用Biomarker Wizard TM 3.1 软件和Biomarker Patterns TM 5.0 软件分析数据。统计分析采用方差分析法和秩和检验法。计算决策树模型诊断的准确率以及盲法验证模型诊断乳腺癌的敏感性和特异性。结果 在决策树模型组中检测到了47 个差异有统计学意义的蛋白峰(P<0.050)。应用BPS5.0 软件,以相对损失最小的原则从这47 个蛋白峰中选取了4 个蛋白峰,分别为相对分子质量(Mr ,本文中相当于质荷比m/ z) 9292.5、Mr 11707.2、Mr 15504.5 和Mr 16107.9,用其建立决策树模型(乳腺癌诊断模型)。该模型判断乳腺癌、乳腺良性疾病及健康人的准确率分别为99.09%、95.58%、92.86%。盲法验证该模型诊断乳腺癌的敏感性为71.43%,特异性为88.89%。结论 应用MALDI-TOF-MS 联合磁珠技术可以检测乳腺癌血清中差异蛋白峰并可以建立决策树(乳腺癌诊断)模型。选择的4 个差异蛋白蜂建立的决策树模型诊断乳腺癌具有好的准确性和较好的敏感性及特异性。决策树模型能将乳腺癌与乳腺良性疾病及健康人相鉴别。寻找到的Mr 9292.54、Mr 11707.2、Mr 15504.5以及Mr16107.9 的蛋白峰有望成为鉴别乳腺癌与乳腺良性疾病和健康人的有效的肿瘤血清蛋白标记物。

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更新日期/Last Update: 2012-01-20